La Iglesia de San Juan Bautista es quizás, el edificio mas importante y visible de Coyoacán, en México D.F. Los dominicos levantaron un edificio provisional en 1528 sobre un Calmecac cuyas ruinas se conservan bajo uno de los claustros del convento. La construcción del templo actual se inicio en la segunda mitad del siglo XVI y durante los dos siglos posteriores.
A un costado del templo de San Juan Bautista se conserva un arco de la entrada atrial norte de san Juan Bautista, fue movido y reubicado alrededor de 1880. Ahora sirve de entrada a un pequeño cementerio a un lado de la iglesia.